Японские аквариумы различаются по месту расположения, формам, объемам воды, количеству обитателей. Так, один из них расположен на крыше токийского общественно-торгового центра в районе Икэбукуро в 40 метрах над землей. Это единственный в мире надземный аквариум.

Океанариум «Окинава Тюрауми» (Okinawa Churaumi Aquarium) — второй по величине аквариум в мире. Он является частью Океанического выставочного парка в Мотобу, который открыли в 2002 году. Океанариум находится в глубине парка в 5 минутах от входа и построен на склоне холма. Благодаря этому этажи здания расположены ступенчато, создавая эффект постепенного погружения вниз. Океанариум устроен с таким расчетом, чтобы наиболее полно отобразить морскую жизнь острова. Аквариум разделен на три зоны: коралловые рифы и мир мелководья; течение Куросио, теплые воды которого служат домом для многих морских видов; и глубоководная часть — то, что скрыто от простого взгляда. Живые существа, обитающие в каждой из зон, поразительно отличаются друг от друга.